不同参考基因组对RAD-seq分析中SNP Calling的影响
该研究围绕两种不同参考基因组:使用近缘种(即枫杨:Pterocarya stenoptera)作为参考基因组,以及利用物种本种(即黄杞)作为参考基因组。研究发现在使用物种本种作为参考基因组与使用近缘种作为参考基因组之间获得的SNP数量存在显著差异,即本种作为参考基因组产生的SNP数量明显多于使用近缘种作为参考基因组的情形。这一结果表明,选择物种本种的参考基因组为SNP Calling的最优方案;若物种本种参考基因组不可用,则可考虑使用近缘种的参考基因组,同时建议避免选用亲缘关系较远的物种。此项研究强调了参考基因组选择对SNP Calling的影响,丰富了我们对RAD-seq数据分析的理解。
2024-05-07
二氧浓度升高对亚热带植物叶片气体交换、生长和水力结构的影响
常绿和落叶植物的生物量随着CO2浓度升高均增加,其中常绿植物物种间的变异较大。相对于常绿植物,落叶植物的叶比导率随着CO2浓度的升高得到的促进作用更强,CO2浓度升高的情况下叶比导率的变化主要受到生物量的影响。CO2浓度升高促进了枝条水分输导能力与叶片气体交换、磷含量以及生物量之间的协同关系。该项研究有助于预测在气候变化的背景下亚热带森林的树木生理特征、生长以及群落演替的变化。
2024-04-30
豌豆经典卷须突变体调控基因的研究进展
利用常规PCR和测序分析进行精细定位发现,AF基因座高度关联到两个串联排列的PsPLAM1a和PsPLAM1b基因,它们都编码C2H2的锌指蛋白转录因子,与已报道的蒺藜苜蓿PALM1、鹰嘴豆MPL1和耧斗菜POP为直系同源基因;在af突变体中包含PsPLAM1a和PsPLAM1b的基因座发生了复杂的大片段的缺失。进一步原位杂交显示PsPALM1a和PsPALM1b在早期复叶原基基部小叶原基中特异性高表达,而在复叶原基顶部(将来发育为卷须的区域)和托叶原基低表达。
2024-04-28
寄生习性驱动菟丝子属的质体基因组结构变异和基因丢失
旋花科植物的质体基因组结构变异多样,其中结构重排有9种类型和IR边界扩张收缩有6种类型。比较分析显示这些结构变异与寄生生活型转变密切相关,同时IR边界扩张收缩和大重复片段可能加剧了结构变异。菟丝子属的质体基因组退化呈现为渐进式,仅Grammica亚属的Ceratophorae组中三个种中发生大量的基因丢失。
2024-04-26
云南景谷发现见血飞属荚果化石
见血飞属(Mezoneuron)为豆科云实亚科(Caesalpinioideae)木质大藤本,是指示热带环境的典型类群。其豆荚特化为纸质翅果,腹缝线具翅,果翅脉不规则,形态特征具有较高的辨识度。
2024-04-24
东亚亚热带常绿阔叶林的起源
东亚东南部的亚热带常绿阔叶林是在中新世中期之后由亚洲热带雨林演变而来。而西南地区的亚热带常绿阔叶林则更为古老,其植物区系成分可能在渐新世时期就已基本形成,并随着时间的推移逐渐演化为现今西南部的亚热带常绿阔叶林。
2024-04-22
低温增强植物免疫应答的分子机理解析取得进展
研究揭示了ICE1调控植物免疫应答的新功能,阐明NPR1–TGA3/ICE1模块对植物在低温条件下抵抗病原菌侵染的关键作用。深入解析ICE1协调与免疫应答相关环境信号的关键作用可以拓宽我们对植物–病原体–环境相互作用的理解。
2024-04-10
生态系统中食草动物驱使下笼状防御结构的进化过程:先阻断后刺痛
现今植物对大型哺乳动物的结构防御策略是逐步进化产生的。首先,植物在中等食草动物压力的环境下产生了密枝,随后在强食草动物压力的环境下形成了刺。研究结果强调了密枝作为食草动物防御策略的适应性价值,并明确了大型食草动物是塑造木本植物结构的主要驱动力。
2024-04-08
细根化学多样性及其与根际微生物的互作维持了热带山地多营养级物种共存
亚高山树种化学多样性高于热带树种,但化学多样性的变异较小,这有利于适应较高的非生物压力。热带树种具有较高的化学多样性变异和化学特有性,这有利于物种共存和适应复杂的生物压力。此外,在所有气候带,近缘树种都存在广泛的化学生态位分化,细根化学多样性受系统发育的影响较弱,主要受到非生物和生物压力的调节。
2024-04-08
无根藤(Cassytha filiformis)包含隐存种,破“中国无根藤单物种”论
研究揭示了无根藤在中国及邻近区域的隐存多样性,打破了“中国无根藤单物种”的原有认知,为寄生植物中隐形物种的广泛存在提供了新证据,并揭示了历史气候变化在推动寄生、半寄生物种分化方面的重要作用。
2024-04-03
稳定同位素观测表明海洋气团主导辽东湾大气水汽循环
(1)大气水汽δ2H和δ18O及d-excess在季节和日尺度上随着观测高度呈现显著不同的变化特征,特别在季风活动强烈的2019年;(2)降雨等天气事件会影响大气水汽稳定同位素信号,但是,大气水汽δ2H和δ18O及d-excess与水汽混合比、相对湿度和空气温度仅存在弱相关关系;(3)结合HYSPLIT后向轨迹模型分析,该地大气水汽δ2H和δ18O及d-excess主要受季风活动主导,直接受到水汽源地同位素信号和水汽传输过程中对流运动的影响。高频的大气水汽δ2H和δ18O原位连续观测将有助于我们进一步解析不同地区典型生态系统(如热带雨林)水汽循环过程。
2024-03-26
凋落物养分循环视角评估胶农复合系统的可持续性
1)胶农复合系统凋落物产量是单层橡胶林的1.3~1.6倍,呈橡胶-可可>橡胶-茶树>橡胶-大叶千斤拔,且凋落物产量高峰期均出现在旱季;(2)胶农复合系统中伴随凋落物归还土壤的C、N、P、K显著增加,各系统间的变化趋势与凋落物产量一致;(3)单层橡胶林表现出最高的P利用效率,推测可能是因为土壤P缺乏导致,间作林下经济作物有助于降低植物的P限制,从而提升生态系统养分循环弹性。因此,综合考虑橡胶生产和生态功能,构建多物种的胶农复合系统是一种行之有效的可持续利用和管理模式。
2024-03-26
质体系统发育基因组解析兰属植物的多样性演化历史
兰属植物多样化速率呈下降趋势,与温度和季风强度变化呈正相关。季风增强提高水热条件可能加快了物种多样化,而随后全球气候变冷可能与多样化速率减缓有关。进一步分析表明生活型从附生到地生的转变可能与适应寒冷环境相关,进而地生兰迁入北部的亚热带生态位。因此,本研究为未来兰属的系统分类学与保护生物学研究奠定了基础,同时为季风活动和温度变化如何影响东南亚植物多样性演化提供了新的例证。
2024-03-25
构建生态安全格局优化保护与恢复目标
研究结果表明:(1)西双版纳优先保护区的总面积为2467.71km2,占研究区总面积的12.88%。其中,生物多样性和生态系统服务的优先保护面积为2283.04km²;生态廊道的优先保护面积为184.67km²。(2)优先恢复区的总面积为514.67km2,占总面积的2.69%。其中,生物多样性和生态系统服务的优先恢复面积为485.14km²;生态廊道的优先恢复面积为29.53km²。(3)重要的生态廊道有213条,其中物种廊道约占总数的50%;重要的生态踏脚石面积为214.2km²,其中超过1km²的有44个。
2024-03-25
叶片功能性状的种内变异和协同变化促进植物适应复杂生境
斜叶榕的叶功能性状存在显著的种内变异,且半附生斜叶榕经历了更加复杂多变的垂直生境,相比地生斜叶榕其具有更强的冠层适应特征。此外,不论是半附生斜叶榕还是地生斜叶榕,均能通过性状组的协同变化来适应不同生长阶段的环境。该研究发现多尺度的植物功能性状的种内变异和协同变化可帮助植物适应复杂多变的生境,并强调了种内变异在探究基于性状的植物适应策略中的重要性。
2024-03-04
依托生态保护红线推进保护地体系融入公共管理
该研究基于景观与地理空间视角,提出了依托生态保护红线将生产空间、生活空间、生态空间(“三生空间”)与保护地体系在国土空间范畴下进行优化整合,有助于不同功能区的识别和划分,有利于协调保护、发展与公共管理等事宜。
2024-02-19
基于校园花园培养儿童对自然的兴趣
该研究共有24名四年级儿童参与,每周在花园里开展一次大约30-40分钟的活动。为了评估儿童个人兴趣的发展,研究者为每名参与者建立了个人档案,其中包括活动前、活动过程中和活动结束后的个人问卷、自然笔记、观察记录和访谈记录。研究结果表明,其中的17位同学表现为对自然兴趣增加或开始对自然产生兴趣,学校花园以其独特而安全的环境,为学生提供了新颖、自主的探索空间,加之教师的支持和指导,激发了儿童对自然的好奇;儿童在活动期间和活动结束后的社交互动,进一步增强了儿童的积极体验(图1)。这些因素结合在一起,培养了儿童对自然的兴趣。该研究强调了校园花园项目对儿童兴趣的积极影响,显示出学校花园对培养儿童对自然的兴趣的潜力。
2024-02-18
研究揭示蒺藜苜蓿复叶模式建成的新机制
中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)热带植物资源可持续利用重点实验室陈江华团队前期的研究以蒺藜苜蓿三出复叶为模型,解析了SGL1/MtLEAFY途径所关联的分子调控网络决定小叶原基起始(He et al.,2020;Mo et al.,2021)。最近,该团队在The Plant Cell杂志上在线发表了题为"GRAS transcription factor PINNATE-LIKE PENTAFOLIATA2 controls compound leaf morphogenesis in Medicago truncatula"的研究论文,进一步深入解析了复叶发育中负责整合和协调小叶原基起始和小叶边界划分两个发育事件的分子机制(He et al.,2024)。
2024-02-07
西双版纳地区轻木栽培研究取得进展
西双版纳地区4年生轻木(4年即可成材)平均胸径为27.7厘米、茎干高度为5.8米、茎干材积为196.0 立方米/公顷,雨季胸径增加量占全年增加量的60%以上。在西双版纳地区土壤交换性钙、镁和速效磷含量的增加可以显著促进轻木的生长,而土壤交换性铝对轻木生长有明显的抑制作用。旱季较低的土壤水分含量和温度不利于轻木生长,林下覆膜栽培经济作物不仅可以显著提高复合林综合经济收益,而且能够提高土壤养分的有效性及旱季深层土壤水分。
2024-02-05
社区共管与生态价值实现为保护地社区关系协同发展提供新路径
建立自然保护地将不可避免地影响周边居民的传统生计与社区发展。妥善处理好自然保护地与社区协调可持续发展问题,不仅是解决自然保护地与社区发展矛盾的现实需要,也是建立以国家公园为主体的自然保护地体系的长期目标之一,更是自然保护地制度体系改革亟需关注的现实问题。
2024-02-01