国家自然科学基金项目
(1) 国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目（组织间合作研究—NSFC-NSF项目(中美)）“BoCP: US-China:榕-蜂共生体系性状创新在增加生物多样性中的贡献”，项目编号：32261123001，执行年限：2022.10-2027.09，经费：180万元，彭艳琼主持（与华东师范大学联合申请，经费共450万元）。
(2) 国家自然科学基金面上项目“局域尺度下种间互作和寄主特征如何决定榕小蜂群落构建？”，项目编号：32171527，执行年限：2022.01-2025.12，经费：58万元，王波主持。
(3) 国家自然科学基金面上项目“榕小蜂主动传粉的演化机制”，项目编号：32070487，执行年限：2021.01-2024.12，经费：58万元，彭艳琼主持。
(4) 国家自然科学基金青年基金项目“榕树-传粉榕小蜂-非传粉榕小蜂的协同系统发育研究”，项目编号：31800313，执行年限：2019/01-2021/12，经费：23万元，黄建峰主持。
(5) 国家自然科学基金面上项目“多营养级榕小蜂群落构建机制”，项目编号：31770463，执行年限：2018.01-2021.12, 经费：59万元，王波主持。
(6) 国家自然科学基金面上项目“蚂蚁-小蜂-榕树体系营养级联强度的动态变化特征及其机制”，项目编号：31570418，执行年限：2016.01-2019.12，经费：63万元，王波主持。
云南省自然科学基金项目
(7) 云南省重点研发计划，建设面向南亚东南亚科技创新中心专项-云南省国际联合创新平台，云南省热带亚洲榕-蜂群落构建与利用国际联合实验室，执行年限：2026.01-2028.12，经费：286万元，彭艳琼主持。
(8) 云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项项目“榕-蜂传粉互作体系协同进化的地理镶嵌模式研究”，项目编号：无，执行年限：2025/01-2029/12，经费：29万元，黄建峰主持。
(9) 云南省应用基础研究计划项目面上项目“印缅区植物地理分布格局及其形成机制研究—以榕属植物为例”，项目编号：202301AT070378，执行年限2023/06-2026/05，经费：10万元，黄建峰主持。
(10) 云南省科技厅基础研究计划面上项目“高度专性传粉植物种间杂交和基因渐渗研究”，项目编号：2019FB034，执行年限：2019.07-2022.06，经费：10万元，黄建峰主持。
(11) 云南省基础研究专项重大项目“苍山综合科学考察”子课题“苍山动物资源本底调查”，项目编号：202201BC070001，执行年限：2022.01-2024.12，经费：30.4万元，彭艳琼主持。
(12) 云南省重大科技专项计划子课题“云南农业跨境重大病虫草关键防控技术研究与推广”，项目编号：202102090003，执行年限：2021.01-2023.12，经费：30万元，彭艳琼主持。
(13) 云南省科技厅基础研究计划面上项目，“榕-蜂系统食物网和化学通讯网互作机制”，项目编号：2016FB050，执行年限：2016.10-2019.09，10万元，王波主持。
其它项目
(14) 广州市林业和园林科学研究院，珍贵树种良种选育与应用示范共同攻关研究服务项目方向一:功能性树种资源选育与品质提升攻关)，执行年限：2023.11-2027.12，经费：30万元，彭艳琼主持。
(15) 植物多样性与特色经济作物重点实验室自主研究课题建，中南半岛榕属（Ficus）植物资源收集及其生物多样性演化机制研究，执行年限：2025.01-2025.12，经费：30万元，彭艳琼主持。
(16) 中国科学院-“一带一路”国际科学组织联盟可持续发展研究计划， 尼泊尔可持续发展问题综合研究，执行年限：2024.08-2028.08，经费：30万元，杨永平主持，彭艳琼执行。
(17) 科技部国家重点研发计划“林木优异种质资源形成基础与挖掘创新”，项目编号：2022YFD2200100，执行年限：2023.01-2027.12，经费：100万元，高洁主持。
(18) 广州市林业和园林局专项资金“榕属迁地保护及应用研究”，项目编号：JYYB-202208-02，执行年限：2022.11-2024.12，经费：48.74万元，彭艳琼主持。
(19) 中国科学院国际合作局“2022年度一带一路暨发展中国家科技培训班项目”，执行年限：2022.01-2022.12，经费：45万元，彭艳琼主持。
(20) 中国科学院国际合作局“第十届国际榕树论坛”，执行年限：2022.1-2022.12，经费：自筹，彭艳琼主持。
(21) 中国科学院西部青年学者项目“伴生微生物在传粉榕小蜂欺骗性演化中的作用”，项目编号：无，执行年限：2022.01-2025.12，经费：50 万元，高洁主持。
(22) 林木遗传育种国家重点实验室开放课题“杂交渐渗对松属物种适应性变异进化的影响”，项目编号：TGB2021002，执行年限：2023.01-2025.12，经费：5 万元，高洁主持。
(23) 中国科学院动物研究所协作项目“草地贪夜蛾信息素测试项目”，项目编号：无，执行年限：2020.09-2022.12，经费：10万元，王波主持。
(24) 国家科技基础资源调查项目“中国东部热带亚热带典型农林交错带传粉昆虫资源调查与评估”，项目编号：2018FY100406，执行年限：2019.01-2022.12，经费：74万元，彭艳琼主持。
(25) 中国环境科学研究院生物多样性调查评估项目“高黎贡山-碧罗雪山地区昆虫多样性调查与评估”，项目编号：2019HJ2096001006，执行年限：2019.06-2022.08，经费：60万元，彭艳琼主持。
(26) 生物多样性保护重大工程专项“生物技术和生物入侵对生物多样性的影响评估”，项目编号：9-4-13-35-2，执行年限：2019.07-2020.07，经费：15万元，王波主持。
(27) 中国科学院“西部之光”人才培养计划西部学者B类项目“高度专性传粉植物种间杂交研究”，项目编号：无，执行年限：2019.01-2021.12，经费：15万元，黄建峰主持。
(28) 中科院生物多样性专项“昆虫多样性监测专项网平台运行费”，项目编号：无，执行年限：2020.01-2021.12，经费：5万元，彭艳琼主持。
(29) 中国科学院修购专项设备项目“花粉孢子自动采样器“，项目编号:2021P301，执行年限：2021.01-2021.12，经费：52.16万元，苗白鸽负责申请、验收。
(30) 中国科学院修购专项设备项目“三维X射线显微镜系统”，项目编号：2019P308，执行年限：2018.12-2019.12，经费：500万元，彭艳琼负责申请、验收。
(31) 昆虫多样性监测专项网平台修购项目“自动临界点干燥仪”，项目编号：2019P309，执行年限：2018.12-2019.12，经费：15万元，彭艳琼负责申请、验收。
