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刘芳

性别:

职称:助理研究员

邮箱:liufang@xtbg.ac.cn

研究方向:

植物比较基因组学与进化生物学。基于多组学方法研究橡胶树乳管发育模式与机制;基于基因组学与分子生物学实验相结合的方法,探索植物基因组突变模式、演化机制及核质互作,以解析基因组复杂性的成因。

学习经历

2018.09-2021.06,中国科学院昆明植物研究所,生物化学与分子生物学,博士

2011.09-2014.06,河南师范大学,细胞生物学,硕士

2007.09-2011.06,河南城建学院,生物工程,学士


工作经历

2024.02-至今,中国科学院西双版纳热带植物园,中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室,助理研究员

2021.07-2023.09,中国科学院昆明植物研究所,中国西南野生生物种质资源库,博士后

2017.05-2018.08,中国科学院昆明植物研究所,科研助理


代表论著

(1)Fang Liu#, Weishu Fan#, Jun-Bo Yang, Chun-Lei Xiang, Jeffrey P. Mower, De-Zhu Li, Andan Zhu. Episodic and guanine–cytosine-biased bursts of intragenomic and interspecific synonymous divergence in Ajugoideae (Lamiaceae) mitogenomes, New Phytologist, 2020, 228(3):1107-1114. 

(2)Weishu Fan#, Fang Liu#, Qiaoya Jia, Haiyuan Du, Wu Chen, Jiwei Ruan, Jiajun Lei, De-Zhu Li, Jeffrey P. Mower, Andan Zhu. Fragaria mitogenomes evolve rapidly in structure but slowly in sequence and incur frequent multinucleotide mutations mediated by microinversions, New Phytologist, 2022, 236(2):745-759.

(3)Qing Duan#, Fang Liu#, Daping Gui, Weishu Fan, Guangfen Cui, Wenjie Jia, Andan Zhu, Jihua Wang. Phylogenetic Analysis of Wild Species and the Maternal Origin of Cultivars in the Genus Lilium Using 114 Plastid Genomes, Frontiers in Plant Science, 2022, 13:865606. 

(4)Feifei Zhang#, Yixi Liu#, Fang Liu#, Jun Yang, Amir Sohail, Chengkai Lu, Peng Xu. Genome-wide characterization and analysis of rice DUF247 gene family. BMC Genomics. 2024, 25(1):613.

(5)MengqingZhe, Le Zhang, Fang Liu, Yiwei Huang, Weishu Fan, Junbo Yang, Andan Zhu. Plastid RNA editing reduction accompanied with genetic variations in Cymbidium, a genus with diverse lifestyle modes, Plant Diversity, 2021, 44(3):316-321.

(6)Wu Chen, Hong Wan, Fang Liu, Haiyuan Du, Chengjun Zhang , Weishu Fan, Andan Zhu . Rapid evolution of T2/S-RNase genes in Fragaria linked to multiple transitions from self-incompatibility to self-compatibility. Plant Diversity. 2022, 45(2):219-228.

(7)Weishu Fan, Zheng-Shan He, Mengqing Zhe, Jing-Qiu Feng, Le Zhang, Yiwei Huang, Fang Liu, Jia-Lin Huang, Ji-Dong Ya, Shi-Bao Zhang, Jun-Bo Yang, Andan Zhu, De-Zhu Li. High-quality Cymbidium mannii genome and multifaceted regulation of crassulacean acid metabolism in epiphytes, Plant Communications, 2023, 4(5):100564.

(8)Xin Jin, Haiyuan Du, Chumeng Zhu , Hong Wan, Fang Liu, Jiwei Ruan, Jeffrey P. Mower, Andan Zhu. Haplotype-resolved genomes of wild octoploid progenitors illuminate genomic diversifications from wild relatives to cultivated strawberry. Nature Plants. 2023, 9(8):1252-1266. 


承担科研项目情况

1.主持项目

(1)地方政府部门,云南省2021年博士后定向培养资助,筋骨草亚科线粒体基因组替代速率异质性的核质共进化研究,2022.01-2023.08,16万元,主持;

(2)中国西南野生生物种质资源库,自主部署科研类项目,草莓属线粒体基因组不同区间替代速率演化模式与机制研究,2021.01-2021.12, 10.094万元,主持。

2. 参与项目

(3)国家自然科学基金面上项目,兰属植物光合碳代谢途径的分子基础研究,2024.01-2027.12,50万元,主要参与人。

(4)国家自然科学基金委员会,面上项目,植物核质分子互作演化研究——以筋骨草亚科为例,2023.01-2026.12,54万元,主要参与人;

(5)国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,RNA编辑在裸子植物质体基因组中演化机制的研究,2019.01-2021.12,26万元,参与;