珍稀濒危物种三棱栎的群体基因组学与保护策略研究
三棱栎(Trigonobalanus doichangensis (A. Camus) Forman)隶属于壳斗科三棱栎属,目前仅分布于中国云南南部和泰国北部清迈。由于生境破坏和种群数量减少,目前已经被列入国家二级重点保护植物和极小种群野生植物,同时在世界自然保护联盟(IUCN)中列为濒危物种。
为了弄清三棱栎居群的现状与遗传多样性,更好地指导三棱栎的保护工作,植物系统发育与保护生物学研究组硕士研究生虎灵在孟宏虎副研究员和合作导师寸玉鹏研究员的指导下,对我国三棱栎分布范围内(普洱市大寨水库、西双版纳傣族自治州帕滇梁子、沧源县城边、沧源县南板村、孟连县灯盏寨、澜沧县东回乡)的6个居群39个个体进行了基因分型测序(Genotyping by sequencing),并开展了群体基因组学分析,从遗传多样性,遗传结构,遗传分化和基因流等方面对三棱栎进行了保护生物学研究。
研究结果表明,三棱栎居群具有较高的遗传多样性和中等程度的遗传分化,其中孟连县灯盏寨和西双版纳州帕滇梁子两个居群的遗传多样性最高;遗传结构分析揭示三棱栎居群存在3个遗传组分,个别居群存在遗传混合;同时,TreeMix分析进一步指出,三棱栎居群间存在一定的基因流。在掌握三棱栎基本遗传信息的基础上,提出可以对三棱栎居群采取人工育苗并移栽至生境特征类似的区域,从而扩大种群规模,保护物种基因库;同时建议对具有较高遗传多样性的孟连县灯盏寨和西双版纳州帕滇梁子居群进行就地保护。该研究成果为三棱栎物种的科学有效保护提供了重要的基础信息与指导意见。
该研究结果以“Conservation Significance of the Rare and Endangered Tree Species,Trigonobalanus doichangensis (Fagaceae)”为题发表于生物多样性期刊Diversity。该研究得到中国科学院东南亚生物多样性研究中心项目,中国科学院青促会以及“西部之光—西部学者”项目的联合资助。
三棱栎居群的遗传结构 (a, b ,c) 与基因流检测结果 (d, e)