细胞分裂素处理后小桐子花序分生组织的转录组分析
能源植物小桐子 (Jatropha curcas)为大戟科多年生木本植物,其种子油是加工生产生物燃油的优质原料。版纳植物园能源植物分子育种组前期的研究发现,用细胞分裂素处理能源植物小桐子,可以增加其小花总数和雌花数,并能诱导产生两性花,从而提高其种子产量。
该研究组的潘帮珍博士与其合作者一起在徐增富研究员的指导下,采用高通量测序的方法对细胞分裂素处理后不同时间点的小桐子花序分生组织进行转录组测序,共获得了703,755条平均长度为364bp的高质量序列。经过拼接后,获得23,591个unigene(平均长度为740bp)和58,920个singleton。根据基因差异表达结果,分析了细胞分裂素以及其它一些激素合成、代谢和信号路径、开花相关,以及与细胞分裂相关基因的表达变化,并对部分基因的差异表达进行了验证。与已有的模式植物拟南芥的相关研究进行比较,发现小桐子ABCE模型同源基因与拟南芥中ABCE模型基因响应细胞分裂素存在差别,这些差别可能是导致小桐子和拟南芥响应细胞分裂素产生不同表型的原因。另外,研究者筛选出了一些与细胞分裂相关的,可能参与细胞分裂素处理后小桐子小花数量增加这一过程的基因。下一步的研究将克隆这些功能基因,构建植物表达载体,进行小桐子转化,从而对这些基因的功能进行验证。
相关结果以Transcriptome of the inflorescence meristems of the biofuel plant Jatropha curcas treated with cytokinin为题发表于国际专业期刊BMC Genomics。
(a)454转录组测序结果得到的花发育相关基因的表达模式
(b) 花发育相关基因表达差异的实时荧光定量PCR验证
图 花发育相关基因的表达模式