高性能计算集群（HPC）自2016年投入使用以来，承担我园多个研究组科研大数据的分析处理任务，为我园科研事业的发展发挥重要的支撑作用。在近6年的运行和管理过程中，HPC主要存在以下几个方面的问题：（1）作业调度系统LSF和并行文件系统Lustre均为商业软件，系统升级维护成本较高；（2）Linux系统版本号较低，一些新型应用软件无法安装；（3）Lustre并行文件系统太复杂，占用较多的硬件资源，使HPC资源利用率偏低；（4）Lustre并行文件系统存在bug，经常出现计算节点挂载不上的情况；（5）节点计算能力和磁盘存储空间偏低，不能满足用户需求。 

　　基于上述问题，中心HPC管理人员（周翔）依托中国科学院仪器设备功能开发项目（高性能计算集群并行文件系统的升级改造），利用有限经费，与云南宇儒科技有限公司合作开展HPC的升级改造，该项工作分3个阶段进行：（1）前期，对项目申请书的实施方案进行可行性论证、测试和优化完善；（2）中期，在保留原超算系统的前提下，重启搭建新的超算系统（操作系统为Centos 7.0，作业调度系统为SGE，并行文件系统为NFS，新增内存为1T胖节点和存储空间为112T文件存储设备各1台），供用户试用；（3）后期，根据超算用户的反馈意见（新旧超算系统的运行使用情况），对实施方案进行再次优化，整合超算新旧系统。 

　　截止2021年11月7日，中心已完成HPC升级改造的前期和中期工作，目前新旧系统均正常运行。新的超算系统搭建完成后，中心于2021年11月8日上午（09:30-10:30）在中心实验室举办“超算升级改造后新系统使用及软件安装”的简短培训，来自生物多样性研究组、协同进化组、药用植物资源保护与利用组、网络中心共10多人参加了此次培训。

HPC新系统使用及软件安装培训