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中心实验室人员派员参加2015年“基因组科学与信息”培训研习班
发表日期:2015-10-20 曹力 打印 放大 缩小 【关闭】
为进一步完善版纳植物园二代高通量测序平台,满足大量测序数据的处理分析,版纳植物园公共技术服务中心通过2014年“修购专项”购置了一套适合版纳植物园现阶段的生物信息数据分析工作站(小型高性能计算机群)。 超算集群于2014年 12 月完成调试安装,投入使用,至目前超算系统已经运行了近一年,处于良好稳定运行状态。已为我园12个课题组27位用户提供了超算服务。
为了更好地运用基因组学和生物信息学的方法实现知识、数据的有效转化和利用,解决在软件安装、数据库和集群使用方法等方面遇到的问题,中心实验室于2015年10月10日派曹力、周翔参加由中国科学院北京基因组所举办的“基因组科学与信息”培训研习班。此次研习班将基因组学领域研究的最新理论和技术与国内生命科学研究紧密结合起来,介绍从第一代测序到未来第四代测序技术的原理及应用。并设计了与理论课程配套的上机实践,让我们亲手操作Linux集群服务器来完成大规模数据信息的处理,主要包括RNA-seq数据分析,泛基因组数据分析,DNA甲基化测序数据分析及CHIP-seq测序数数据分析等。
本次培训不仅增强了中心实验室参会人员的超算集群应用操作技能,还开拓了他们的科技视野,同时加强了与院内单位的合作交流。本次培训将促进版纳植物园超算在科学研究中发挥出更大的价值。(曹力撰文)
培训班授课
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