实验室与国内外相关高校、科研院所和企业有着广泛的交流，团队多数成员都有国内外其他单位学习和工作背景。在国内合作方面，与云南大学、兰州大学、四川农业大学、西南林业大学、云南省农科院、云南农业大学等有着长期的合作与交流。
目前，项目依托单位版纳植物园与缅甸、泰国、老挝等东南亚国家签订了相关科技合作备忘录，建立了良好的合作网络和研究平台，并成立了东南亚中心，中缅科教中心和老挝、泰国国家项目办公室，为项目有效开展提供合作平台和政策保障。重点实验室有3名外籍专家担任研究组长，3名外籍助理研究员，4名外籍博士后和15外籍研究生。
