1. 西双版纳热带植物园“十四五”规划主攻方向，橡胶树全基因组选择育种技术研发及应用，2023.07-2025.12，500万，在研，任务负责人之一。

2. 云南省科技厅重大科技专项计划项目，橡胶树产胶潜力和抗逆性全基因组选择技术研发及育种应用，2024.01-2026.12，400万，在研，课题负责人。

3. 2023年度院引才计划青年项目择优支持，橡胶树高产稳产分子基础：乳管分化和割胶耐受性研究， 2024.01-2026.12，200万，主持。

4. 中国科学院前沿局，YSBR-079，云南橡胶树种质资源退化与改良，2022.7-2025.7，2000万，在研，核心成员。

5. 国家自然科学基金面上项目，32270716，基于单细胞(核)比较转录组解析禾本科植物气孔发育 和运动调控的分子基础，2023/01-2026/12，54万，在研，主持。

6. 中国科学院西双版纳热带植物园，作物重要性状形成和调控机理，科研启动经费，2022-2026， 在研，主持。

7. 国家自然科学基金面上项目，31771414，水平基因转移在寄生植物菟丝子基因组中的全面鉴定及其进化意义和发生机制研究，2018/01-2021/12，60万，已结题，主持。

8. 河南省科技厅，18HASTIT041，2018年度河南省高校科技创新人才，寄生植物菟丝子基因组水平的HGT研究，2018/01- 2020/12，60万，已结题，主持。

9. 中国烟草总公司云南分公司，2018530000241001，烟碱累积调控网络初步解析及高烟碱烤烟新品系的培育，2018.06-2019.12，80万，已结题，主持。

10. 河南大学，黄河学者项目启动经费，2016.7-2020.7，50万，已结题，主持。

11. NSFC-云南联合基金，U1502263，玉米丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号系统抗虫功能及分子机理研究，2016.01-2019.12，258万，已结题，第一参与人。

12. 国家自然科学基金面上项目，31470012，植物mRNAs在寄生体系中的长距离运输及功能研究，2015/01-2016/12，30万，已结题，主持。

13. 国家自然科学基金青年项目，31301037，根寄生和茎寄生植物中的水平基因转移研究及其机制探讨，2014.01-2016.12，23万，已结题，主持。

14. 云南省自然科学基金委，菟丝子对寄主RNA 的“掠夺”和基于RNAi 技术的生物防治，2013.10-2016.9，10万，已结题，主持。

15. 中国科学院西部之光，水平基因转移对根寄生植物的影响及其发生机制探讨，2015/09-2017/09，30万，已结题，主持

16. 云南省科技厅，云南省中青年学术带头人后备人才，植物中的水平基因转移， 2015.1-2017.12，12万，已结题，主持。

17. 云南省烟草农业科学研究院横向项目，基于二代测序不同烟草组织中的基因差异表达研究，2013.4-2015.10，107万，已结题，主持。

18. 中国科学院人才引进项目，2011.12-2014.11，植物与寄生植物的相互作用研究， 20万，已结题，主持。

19.中国科学院昆明动物研究所遗传与资源国家重点实验室，人贾第虫和蛙贾第虫的比较基因组学研究， 2013.05-2015.04，11万，已结题，主持。

20. 教育部留学归国基金，2013.1-2015.12，菟丝子从宿主转运的mRNA种类和转运机理探讨，3万，已结题，主持

21. 云南省基金委项目，糖酵解和糖异生途径在衣藻细胞内的定位及其进化研究，2009.1-2011.12，5万，已结题，主持。

22. 美国自然科学基金项目(USNSF)，2009.1.-2014.12，水平基因转移及其对生物类群关系重建的影响（Horizontal Gene Transfer and among Phyla Relationships），主要参加人员

23. 科技部973项目课题，2007.07-2011.0，基因和基因家族/群功能的选择和进化，主要参加人员

24. 国家基金委面上项目，2006.01-2008.12，以由质体转移到核的基因为标记探讨眼虫类的系统演化，主要参加人员

25. 国家自然科学基金：拟南芥VQ蛋白与DELLA互作调控ABA信号转导及种子萌发的分子机制，2021年1月–2024年12月，42万元，主持人。

26. 云南省应用基础研究计划：拟南芥VQ蛋白与WRKY25/WRKY33互作调控ABA信号转导及种子萌发的分子机制，2020年6月–2023年5月，5万元，主持人。