基于黄杞RAD-seq数据重建海南岛与大陆生物古地理格局
选取分布于海南岛和邻近大陆地区的黄杞(Engelhardia roxburghiana Wall.)为研究物种,对海南岛及其邻近大陆开展了大规模采样,并基于黄杞的RAD-Seq数据深入探索其遗传多样性、遗传结构、分化时间以及种群动态历史;同时,结合气候模型数据,评估该物种不同时期的适宜分布区域,以期更准确地揭示该区域的生物地理格局。
2024-08-02
云南特有樟科植物系统分类学研究进展
樟科植物是重要的基部被子植物类群,广泛分布于世界的热带和亚热带地区,在中国的特有性中心几乎全部位于热带地区,主要集中在云南的南部与东南部、广西西部、海南和台湾。
2024-06-27
不同参考基因组对RAD-seq分析中SNP Calling的影响
该研究围绕两种不同参考基因组:使用近缘种(即枫杨:Pterocarya stenoptera)作为参考基因组,以及利用物种本种(即黄杞)作为参考基因组。研究发现在使用物种本种作为参考基因组与使用近缘种作为参考基因组之间获得的SNP数量存在显著差异,即本种作为参考基因组产生的SNP数量明显多于使用近缘种作为参考基因组的情形。这一结果表明,选择物种本种的参考基因组为SNP Calling的最优方案;若物种本种参考基因组不可用,则可考虑使用近缘种的参考基因组,同时建议避免选用亲缘关系较远的物种。此项研究强调了参考基因组选择对SNP Calling的影响,丰富了我们对RAD-seq数据分析的理解。
2024-05-07
无根藤(Cassytha filiformis)包含隐存种,破“中国无根藤单物种”论
研究揭示了无根藤在中国及邻近区域的隐存多样性,打破了“中国无根藤单物种”的原有认知,为寄生植物中隐形物种的广泛存在提供了新证据,并揭示了历史气候变化在推动寄生、半寄生物种分化方面的重要作用。
2024-04-03
植被交错带是生物多样性保护的热点区域
以最大熵(MaxEnt)模型模拟当前樟科物种的潜在分布为数据基础,利用DNA条形码ITS构建286种中国樟科植物的系统发育关系,并收集了叶面积、株高等物种功能性状,从物种、进化和功能三个方面分析樟科多维度的多样性空间分布格局。研究发现,中国樟科各多样性指标呈现出不完全一致的空间分布格局,形态特征的平行进化可能是造成功能多样性和其它指标不匹配的原因,多样性指数之间的脱钩突显了不同多样性的互补性以及它们各自在评估保护价值方面的作用;综合各多样性指标,提出中国樟科植物重点保护区域位于西藏南部、横断山脉北部,云南南部和东南部,以及秦岭和淮河南北分界的区域,而这些区域正是中国亚热带常绿阔叶林与北部的落叶森林、南部的热带森林,西部的高原植被形成的交错区域。这项研究强调了综合多维度多样性指标、以实现最大限度保护中国常绿阔叶林生物多样性的重要性,证实并确立了森林交错带对生物多样性保护的重要价值。
2023-08-28
版纳植物园发表樟科土楠属新种——大果土楠
植物系统发育和多样性保护研究组科研人员在云南省东南部的野外考察中发现了一个特别的未知樟科物种。通过形态学研究,最终确定该物种为樟科土楠属的一个新成员,因其具有巨大的果实而被命名为大果土楠(Endiandra macrocarpa)。与分布于我国南部、西南部和中南半岛临近地区的其他土楠属物种相比,大果土楠在形态学上具有巨大光滑的椭圆形果实(11 x 6 cm),小枝光滑无毛以及花序被微柔毛等特征。目前,该物种仅发现于云南省马关县,分布区域狭窄,个体稀少,应在保护上予以重点关注。
2023-05-17
Multidimensional Evaluation Verifies Transitional Areas as Biodiversity Hotspots
The researchers first mapped and then identified spatial patterns of species richness, phylogenetic diversity, and functional diversity. Using these parameters, they then defined areas of neo- and paleo-endemism for Chinese Lauraceae and identified priority areas for conservation.
2023-02-17
人工经济林正在深刻影响植物的历史采集记录
植物采集记录是生态学、进化生物学以及生物多样性调查与保护等领域的重要数据来源之一。近年来全球种植大面积人工经济林,一方面可以有效消除地区贫困,并在很大程度上减缓了全球二氧化碳浓度上升,有利于应对全球气候变化;然而在另一方面,随着人工经济林的蓬勃发展,许多地方有植物采样历史记录的植物也随之消失。人工经济林正在深刻影响着植物的历史记录,但至今鲜有研究关注这个全球性的现实问题。
2023-01-12
气候变化背景下河岸成为热带北缘濒危树木的避难所
2022-11-11
亚洲热带—亚热带特征植物类群黄杞属的新物种与分类修订
2022-09-01
过渡区受威胁树种的多样性分布格局与保护研究
2022-06-08
珍稀濒危物种三棱栎的群体基因组学与保护策略研究
2022-08-22
纬度多样性梯度格局的回顾与展望
2022-04-27
中南半岛热带至中国亚热带植物地理分布格局的成因探讨
2022-04-02
世界贸易木材树种DNA条形码数据库构建与评估
2021-11-17
叶绿体基因组超级条形码能否用于樟科植物的物种鉴定?
2021-03-24
东亚季风和四川盆地共同塑造金丝楠木的“环状物种分化”
2020-08-31
物种的界定与概念化:从胡桃科黄杞属谈起
2020-08-13
叶绿体基因组助力中国风吹楠属物种界定
2019-12-19
热带雨林中的高海拔气候避难所
2019-08-28