10月9日至15日，第二届国际种群基因组学培训班在中国科学院西双版纳热带植物园成功举办。来自德国马克斯普朗克研究所、荷兰阿姆斯特丹大学、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国科学院植物研究所、中国科学院昆明动物研究所、中国科学院昆明植物所、中国科学院青藏高原研究所、中国科学院华南植物园、中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所、中国林业科学院林业研究所、中国林业科学院亚热带林业研究所、北京师范大学、山东大学、华中农业大学、云南大学、云南省农业科学院药用植物研究所及中国科学院西双版纳热带植物园共17个单位的35名学员参加了培训。

　　组委会邀请到来自美国斯坦福大学Jonathan Karl Pritchard 教授讲授了群体遗传学导论。Jonathan Karl Pritchard 教授在群体遗传学领域具有很深造诣，他早在2000年在Genetics 上发表的群体遗传学structure 软件至今被引用37181次，2015获得Kistler Prize in Population Genetics and Society. Google Scholar H-index 108. Jonathan Karl Pritchard 教授为学员讲授了群体遗传学的经典理论和模型引起了学生热烈的讨论。

　　中国科学院上海免疫与感染研究所杨超副教授为大家详细介绍了从群体测序数据中获得遗传变异（SNP calling） 的全部流程，带领学员进行了实操练习。中国科学院上海免疫与感染研究所Daniel Falush研究员讲授了种群遗传结构分析方法：染色体涂染法(Chromosome painting)，同时为大家教授了fineStructure 软件的实操。

　　中国科学院昆明动物所王国栋研究员介绍了运用群体基因组学揭示家犬进化史、柳延虎副研究员及其两位助手为学员详细介绍了自然选择的类型、具体研究案例及检测方法。

　　英国伦敦大学学院Leo Speidel博士讲授了发表在Nature Genetics 的文章“ A method for genome-wide genealosy estimation for thousands of samples“ 所开发的Relate 分析方法。该方法可用来推断上千个全基因组样本的谱系进化，包括更准确的估算分支时间，群体历史变化，自然选择信号等，并详细教授了Relate 软件的使用方法。

　　复旦大学徐书华教授团队的邓恋教授综合团队近年来发表在Nature, Nature Communication, Molecular Biology and Evolution, National Science Review 等期刊的研究工作为学员深入讲授了亚洲人群基因组分析为人类进化史带来的启示。深刻揭示了如何从群体水平研究基因组的微观进化，以及如何在基因组水平研究群体的遗传和进化规律。

　　中国科学院营养与健康研究所李海鹏研究员介绍了团队2023年9月1日在国际学术期刊Science 在线发表的“Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle Pleistocene transition” 的最新研究成果，详细介绍了他们创建的快速极小时间溯祖新方法（FitCoal）。

　　西湖大学杨剑教授为学员讲授了GREML等一系列方法，利用全基因组单核苷酸多态数据在自然群体中估计复杂性状的遗传率，解释了“遗传率丢失”的主要原因。杨剑老师团队的祁婷博士为学员讲授了分子表型的遗传分析及其与复杂性状的整合，介绍了团队开发的GCTA、SMR、OSCA等计算生物学分析软件，整合GWAS和多组学数据在人类遗传学和基因组学研究领域的一些广泛应用。

　　云南农业大学陈玮副教授为大家讲授了团队2023年 3月发表在国际学术期刊Science 上的封面文章的故事，解析了葡萄的起源和驯化，并向学员传授了如何深度解析研究材料的群体结构、发掘亮点科学问题的宝贵经验。

　　最后，诺禾致源的生信总监姜亚菲老师根据自己多年的项目分析经验为大家讲授了“从个体到群体的多维变异”的各种测序及分析软件检测方法。

　　全体学员及主讲老师就群体基因组学的多个主题进行了分享交流。本次培训班由中国科学院西双版纳热带植物园和中国科学院免疫与感染研究所，复旦大学联合发起举办，北京诺禾致源科技股份有限公司倾力赞助，邀请种群基因组学方向的国内外顶尖科学家团队，聚焦该领域最前沿的研究理论和方法通过一系列讲座、研讨、研究方法实际操作演练，对参与者从理论和方法上进行了一次系统的提升。我们旨在推动国内种群基因组学的发展、提高相关研究人员的理论基础和数据分析水平、为相关科研人员提供交流平台。

会议合影