元江站始终以监测台站监测为中心工作之一。自2011年9月年建站以来，元江站以中国生态系统研究网络（CERN）的技术规范为指导，建立了稀树灌丛生态系统综合观测场，对我国西南干热河谷典型的稀树灌丛生态系统的生物、气象和土壤等生态要素进行了长期定位监测与研究。

生物监测

建立了稀树灌丛1公顷长期监测样地和0.25公顷的采样样地，并进行了样地围栏，开展了群落生态学调查，鉴定样地中胸径≥1 cm的乔木树种，测定胸径和树高，并建立了26个灌木和草本监测小样方，建立了乔灌草植物种类和数量动态、凋落物季节动态、幼苗、物候等生物监测项目并开展了长期监测；采集标本150多份，基本摸清了本地区的种子植物，鉴定的木本植物60多种，草本植物120多种，基本上摸清了元江站附近的种子植物名录。

监测样地：面积为100m×100m，群落为厚皮树、霸王鞭和扭黄茅群落，海拔变化从540-570m之间，坡度从0-30°之间，土壤少，土层薄，土壤类型为燥红壤。立地条件比较差，岩石裸露达70%,元江自然保护区普漂片区的典型植被类型。乔木层主要树种是厚皮树（Lannea coromandedelica）和老人皮（Polyalthia cerasoides），高度在3-8m之间，盖度20-30%。灌木层盖度在35-45%，以霸王鞭（Euphorbia royleana）占优势，样地下部坡度更陡的地方以疏序黄荆（Vitex negundo）占灌木层优势种。草本层高度在10-50cm之间，主要以扭黄茅（Heteropogon contortus）占优势，雨季草本层盖度在60-80%之间。

采样样地：面积为50m×50m，群落也是厚皮树、霸王鞭和扭黄茅群落，海拔为580m，坡度比较缓（≤10°），土壤少，土层薄，土壤类型为燥红壤。立地条件相对也比较差，岩石裸露达70%。采样样地地势比较平缓，具有相对较高的土壤条件。乔木层主要树种是厚皮树（Lannea coromandedelica）、余甘子（Phyllanthus emblica）和高大的霸王鞭（Euphorbia royleana）占优势，高度在3-10m之间，盖度30%以上。灌木层盖度在50%，以霸王鞭（Euphorbia royleana）、宿萼木（Strophioblachia fimbricalyx）占优势。草本层高度在10-50cm之间，主要以扭黄茅（Heteropogon contortus）占优势，雨季草本层盖度在70%。

气象监测

建立了25m×25m的气象观测场，包括人工监测和自动监测。常规气象观测为人工观测，每天3次，气象监测主要内容天气现象、风速风向、干湿球温度、最低和最高气温、毛发湿度、小型蒸发、E601B蒸发、日照时数、降雨量、地面0cm、地面最高、地面最低、5cm、10cm、15cm和20cm地温等。自动气象站监测：空气温湿度、风速风向、太阳辐射、地温、降雨量、日照时数等，每10分钟自动收集一次数据，仪器运行正常。此外，元江站还建立了稀树灌丛森林小气候和通量监测系统，主要的监测指标有：地表1.5处和13.5米两层的空气温湿度、水汽压、风速风向、气压、光量子、8.4米出的长波辐射、短波辐射、光合有效辐射、反射率、土壤0cm、5cm、10cm、20cm、40cm的土壤温湿度、土壤热通量和水气通量监测等指标体系。

水分监测

水分监测主要开展地表径流，树干径流，土壤含水量，地下水，枯枝落叶含水量，地表水、地下水等监测。目前建立了2个稀树灌丛水分观测场，并进行了观测场围栏，安装了不同坡度地表径流2对（4个），不同胸径树干径流16株，穿透雨12个，并开展了稀树灌丛长期观测场的土壤水分动态监测（每5天1次）。监测土壤水分常数，包括土壤质地、土壤完全持水量、土壤田间持水量、土壤水分特征参数等指标。

土壤监测

元江站正在开展样地表层的土壤养分含量和酸度，土壤速效养分，土壤硝态氮和铵态氮动态变化，土壤容重，土壤阳离子交换性能，土壤速效中微量元素等土壤指标体系的监测。